RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF550Q7Z398 422 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIB2Q92519 343 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HS6ST2Q96MM7 605 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PRRT1Q99946 306 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 DPYSL5Q9BPU6 564 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF649Q9BS31 505 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 HDHD5Q9BXW7 423 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SPTBP11277 2137 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRFAM7AQ494W8 412 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC36A3Q495N2 470 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PDSS1Q5T2R2 415 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 COQ10AQ96MF6 247 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 IL4I1Q96RQ9 567 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SMPD4Q9NXE4 827 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 SMLR1H3BR10 107 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 VILLO15195 856 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ELOA3BQ3SY89 546 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 NXPE1Q8N323 547 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 EID2Q8N6I1 236 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 ELOA3Q8NG57 546 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5H6Q8NGV6 325 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 NTAN1Q96AB6 310 aa10.27□□□□□ -0.76
SH3BP2-201ENST00000356331 GMDSO60547 372 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNGR1P15260 489 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ITPKAP23677 461 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 THBS3P49746 956 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DSTNP60981 165 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RAP2BP61225 183 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MAXP61244 160 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CRHR2Q13324 411 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNJ11Q14654 390 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LFNGQ8NES3 379 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GAL3ST1Q99999 423 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC22A31A6NKX4 558 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ECI1P42126 302 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RANP62826 216 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FGFBP1Q14512 234 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GANABQ14697 944 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC5A7Q9GZV3 580 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MS4A12Q9NXJ0 267 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF536O15090 1300 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 D6RAR5 112 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM63AO94886 807 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RHCEP18577 417 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXA9P31269 272 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NUDT1P36639 197 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 GRM2Q14416 872 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 NFIXQ14938 502 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR8J1Q8NGP2 316 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 XAGE5Q8WWM1 108 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SH2B3Q9UQQ2 575 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ASF1AQ9Y294 204 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 DIRAS3O95661 229 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TFPIP10646 304 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 AMD1P17707 334 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 AGAP6Q5VW22 663 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2T33Q8NG76 320 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 MFSD3Q96ES6 412 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 AGAP4Q96P64 663 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ARL6Q9H0F7 186 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TOXO94900 526 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 C14orf28Q4W4Y0 310 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 TMED4Q7Z7H5 227 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 COMTD1Q86VU5 262 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 CNIH3Q8TBE1 160 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RSC1A1Q92681 617 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF181Q9P0P0 153 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL9Q9P2J3 617 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 LAMP5Q9UJQ1 280 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLIT2O94813 1529 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SGCEO43556 437 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 RECQL4O94761 1208 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 BCKDHAP12694 445 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 PKLRP30613 574 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC27A4Q6P1M0 643 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-201ENST00000356331 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms