RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 CLIC3O95833 236 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 NTRK1P04629 796 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 MERTKQ12866 999 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 HS3ST5Q8IZT8 346 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 NCSTNQ92542 709 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 CHRDQ9H2X0 955 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 KLHL31Q9H511 634 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 OLAHQ9NV23 265 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.35■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 METTL12A8MUP2 240 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 SNAP29O95721 258 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 NDUFS1P28331 727 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 BSGP35613 385 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 MAP7Q14244 749 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 UBE3DQ7Z6J8 389 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 NAGSQ8N159 534 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 OR10G6Q8NH81 332 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 PPCDCQ96CD2 204 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 FBXL20Q96IG2 436 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 NELL2Q99435 816 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 SPASTQ9UBP0 616 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 MAPRE3Q9UPY8 281 aa20.34■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 CST1P01037 141 aa20.33■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 CTSEP14091 401 aa20.33■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD34AQ69YU3 496 aa20.33■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 VPS37AQ8NEZ2 397 aa20.33■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.33■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 NT5DC2Q9H857 520 aa20.33■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.33■□□□□ 0.85
SOX17-201ENST00000297316 C4orf51C9J302 202 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TNFAIP8O95379 198 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ETS2P15036 469 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MVDP53602 400 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PLA2G16P53816 162 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SLC36A3Q495N2 470 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 COX20Q5RI15 118 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SATL1Q86VE3 508 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PARGQ86W56 976 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 FAM47BQ8NA70 645 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MAL2Q969L2 176 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 PYURFQ96I23 114 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 LRRC61Q9BV99 259 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ABCG4Q9H172 646 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.33■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TRBC2A0A5B9 178 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 NDUFS4O43181 175 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CCNDBP1O95273 360 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 JUNDP17535 347 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 BCKDHBP21953 392 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CD27P26842 260 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 DMWDQ09019 674 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 RGNQ15493 299 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 DNAJB9Q9UBS3 223 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 VPS4AQ9UN37 437 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 OR6C74A6NCV1 312 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ZNF682O95780 498 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 VIPP01282 170 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CMPK1P30085 196 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CRYBA2P53672 197 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CYGBQ8WWM9 190 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 CLDN23Q96B33 292 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 SLC6A16Q9GZN6 736 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.32■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 KDM1AO60341 852 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 GPR37L1O60883 481 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ARSFP54793 590 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ABATP80404 500 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 VAC14Q08AM6 782 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 HYAL2Q12891 473 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 ZNF425Q6IV72 752 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.31■□□□□ 0.84
SOX17-201ENST00000297316 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms