RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01560Q8TB33 94 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NTNG2Q96CW9 530 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 FAR2Q96K12 515 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC138Q96M89 665 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 H2AFJQ9BTM1 129 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 IL22Q9GZX6 179 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAP2Q9NPF8 381 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 BFARQ9NZS9 450 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOTQ9UBF9 498 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC13O75165 2243 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3D21A4FU49 640 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT87PA6NCN2 255 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CBFA2T2O43439 604 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OR1F1O43749 312 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NIPSNAP2O75323 286 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 MAOAP21397 527 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CTSSP25774 331 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEA1P43355 309 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS4P49798 205 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD17B7P56937 341 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TBPL1P62380 186 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HYAL2Q12891 473 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC13A2Q13183 592 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 POU4F3Q15319 338 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SPA17Q15506 151 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 AMER2Q8N7J2 671 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPV3Q8NET8 790 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8K3Q8NH51 312 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 UCN3Q969E3 161 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NCLNQ969V3 563 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PERPQ96FX8 193 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RASL10BQ96S79 203 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC7Q99615 494 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RHBGQ9H310 441 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 DEPPQ9NTK1 212 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFATQ9P243 1243 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 WWP2O00308 870 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6B1O95007 311 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA16P05015 189 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 APRTP07741 180 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 COX7A2P14406 83 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TNNI3P19429 210 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 IMPA1P29218 277 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 AHRP35869 848 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX3P41225 446 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 NPY2RP49146 381 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 DNASE1L1P49184 302 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR143P51810 404 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 OLR1P78380 273 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 BTG2P78543 158 aa7.27□□□□□ -1.25
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