RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM54-201ENST00000296098 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.87■■□□□ 1.25
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TRIM54-201ENST00000296098 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.86■■□□□ 1.25
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TRIM54-201ENST00000296098 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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TRIM54-201ENST00000296098 LINC01565O15544 149 aa22.84■■□□□ 1.25
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TRIM54-201ENST00000296098 LHX9Q9NQ69 397 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 SCN3BQ9NY72 215 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 KCNK6Q9Y257 313 aa22.84■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 C5orf42Q9H799 3197 aa22.83■■□□□ 1.25
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