RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 CBLL1Q75N03 491 aa16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 CXorf36Q9H7Y0 433 aa16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 FBXW2Q9UKT8 454 aa16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PKN3-201ENST00000291906 H0YAE9 185 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 BCKDKO14874 412 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TMPRSS11DO60235 418 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 POU2F1P14859 743 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 EPHA2P29317 976 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 FMO3P31513 532 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 ACTR1BP42025 376 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 ACTR1AP61163 376 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CSNK1G2P78368 415 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CDK6Q00534 326 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 ADAM15Q13444 863 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 GANABQ14697 944 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 OLIG3Q7RTU3 272 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 PARP8Q8N3A8 854 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 OXR1Q8N573 874 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 YIPF4Q9BSR8 244 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 RHCGQ9UBD6 479 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 ERI3O43414 337 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 EML2O95834 649 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 RAPSNQ13702 412 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TRIM40Q6P9F5 258 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 OR8K5Q8NH50 307 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 FANCEQ9HB96 536 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 EBF1Q9UH73 591 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 A0A1W2PQF6 199 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 C5orf58C9J3I9 102 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 ASGR2P07307 311 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 SLC5A2P31639 672 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 GRK3P35626 688 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CEACAM20Q6UY09 585 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 OR10G6Q8NH81 332 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TM4SF18Q96CE8 201 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 KRT84Q9NSB2 600 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 J3KTA2 159 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 DAPP51397 102 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CDH12P55289 794 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 FBXL6Q8N531 539 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 OR2A1Q8NGT9 310 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 LCN9Q8WX39 176 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 UBE2FQ969M7 185 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa16.07■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 PDPK1O15530 556 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TNFRSF4P43489 277 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 SPIBQ01892 262 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 RGMAQ96B86 450 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 S1PR5Q9H228 398 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 BCHEP06276 602 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 CRYBA2P53672 197 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 PCDH1Q08174 1060 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 ARHGAP19Q14CB8 494 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 HEPACAMQ14CZ8 416 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 RPE65Q16518 533 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 TPRG1LQ5T0D9 272 aa16.06■□□□□ 0.16
PKN3-201ENST00000291906 GPR153Q6NV75 609 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms