RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 PRAMEF25A6NGN4 478 aa18.37■□□□□ 0.53
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USP21-201ENST00000289865 C21orf59P57076 290 aa18.36■□□□□ 0.53
USP21-201ENST00000289865 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa18.36■□□□□ 0.53
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USP21-201ENST00000289865 TAS2R38P59533 333 aa18.35■□□□□ 0.53
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USP21-201ENST00000289865 DNASE1L2Q92874 299 aa18.35■□□□□ 0.53
USP21-201ENST00000289865 MS4A8Q9BY19 250 aa18.35■□□□□ 0.53
USP21-201ENST00000289865 ABCG4Q9H172 646 aa18.35■□□□□ 0.53
USP21-201ENST00000289865 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.35■□□□□ 0.53
USP21-201ENST00000289865 SLAMF7Q9NQ25 335 aa18.35■□□□□ 0.53
USP21-201ENST00000289865 ICKQ9UPZ9 632 aa18.35■□□□□ 0.53
USP21-201ENST00000289865 H7BY64 318 aa18.34■□□□□ 0.53
USP21-201ENST00000289865 SEMA3DO95025 777 aa18.34■□□□□ 0.53
USP21-201ENST00000289865 TFPTP0C1Z6 253 aa18.34■□□□□ 0.53
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