RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 EPPINO95925 133 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 IFNB1P01574 187 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ETS1P14921 441 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FPR1P21462 350 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 JAK1P23458 1154 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ADRA1DP25100 572 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 STIP1P31948 543 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 BTG2P78543 158 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 RUNX1T1Q06455 604 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SLC10A1Q14973 349 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ACKR1Q16570 336 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 OR4L1Q8NH43 312 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PEX13Q92968 403 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ISL2Q96A47 359 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SLC22A7Q9Y694 548 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 E7ENX8 843 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC175P0C221 793 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MAOAP21397 527 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CNR1P21554 472 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SOX3P41225 446 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PNLIPRP1P54315 467 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TAP2Q03519 686 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 GBX1Q14549 363 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 XKR6Q5GH73 641 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 LACC1Q8IV20 430 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ASB15Q8WXK1 588 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PANX3Q96QZ0 392 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EXO5Q9H790 373 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TENM1Q9UKZ4 2725 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 A8MUA0 341 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SMAPO00193 183 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 B4GALT2O60909 372 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 OR2J2O76002 312 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 GAS8O95995 478 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 IL2RAP01589 272 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 APRTP07741 180 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 DNASE1L1P49184 302 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PRAMEP78395 509 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TNK1Q13470 666 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TERF2Q15554 542 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD13Q7L211 337 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 OTOAQ7RTW8 1153 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CAMKVQ8NCB2 501 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 OR6P1Q8NGX9 317 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF480Q8WV37 535 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 IGFBPL1Q8WX77 278 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PKP4Q99569 1192 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf24Q9BVV8 132 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 P2RY12Q9H244 342 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 UBTD1Q9HAC8 227 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TREX1Q9NSU2 369 aa15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087X1B8 175 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB108AA8MXU0 73 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 E7EVH7 732 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CHST10O43529 356 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SLC16A8O95907 504 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PAX1P15863 534 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RPL22P35268 128 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 GPR143P51810 404 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 OLR1P78380 273 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 HYAL2Q12891 473 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SNX1Q13596 522 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms