RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 PCSK6P29122 969 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SLC5A2P31639 672 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SOAT1P35610 550 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 DAPP51397 102 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 ITGA1P56199 1179 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TEAD4Q15561 434 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 MEP1AQ16819 746 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 UAP1L1Q3KQV9 507 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 LAIR2Q6ISS4 152 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 RAB42Q8N4Z0 105 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 NFKBIDQ8NI38 313 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 UCN3Q969E3 161 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PREBQ9HCU5 417 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 C5AR2Q9P296 337 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 BAG5Q9UL15 447 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 MYO10Q9HD67 2058 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 F5P12259 2224 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 A0A0G2JN53 185 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 STATHP02808 62 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TNFRSF1BP20333 461 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 FPR1P21462 350 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 IGFBP5P24593 272 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SERPINB1P30740 379 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 ALDH9A1P49189 494 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 CTBSQ01459 385 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 CD47Q08722 323 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SCARB2Q14108 478 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 KRT33BQ14525 404 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TCEA2Q15560 299 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 RPE65Q16518 533 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SGCDQ92629 289 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 MPP4Q96JB8 637 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 DOHHQ9BU89 302 aa11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 A0A1W2PPC1 479 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 H0Y8X5 98 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 AXIN1O15169 862 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SLC16A6O15403 523 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SERPIND1P05546 499 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 CRHBPP24387 322 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PRIM2P49643 509 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 RAD23AP54725 363 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 ISL1P61371 349 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SELENOWP63302 87 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TFF2Q03403 129 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 FADDQ13158 208 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PMS2P3Q13401 168 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TPRG1LQ5T0D9 272 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 KCTD8Q6ZWB6 473 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 GPR141Q7Z602 305 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 RGMAQ96B86 450 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TAMM41Q96BW9 452 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 FBRSQ9HAH7 460 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 EXD2Q9NVH0 621 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SNX11Q9Y5W9 270 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PRSS38A1L453 326 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 KCNJ13O60928 360 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 EML2O95834 649 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 UQCRC2P22695 453 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 BCL6P41182 706 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 PLA2G16P53816 162 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 RBBP4Q09028 425 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 RFX4Q33E94 735 aa11.92□□□□□ -0.5
PTGS1-201ENST00000223423 ZBED5Q49AG3 693 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms