RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim80Q3V061 624 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rassf5Q5EBH1 413 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyb5d2Q5SSH8 263 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr32Q7TQZ0 308 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1251Q7TQZ3 318 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r81Q80Z09 865 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf768Q8R0T2 568 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Thoc1Q8R3N6 657 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdk9Q99J95 372 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mmp19Q9JHI0 527 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbxo8Q9QZN3 319 aa20.75■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klhl18A0A0G2JGN5 579 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Itih4A6X935 942 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm8444F6XS56 118 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spdye4cI6XKQ3 339 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpini1O35684 410 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serping1P97290 504 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dab1P97318 588 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atf7ip2Q3UL97 452 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ctsll3Q3ULP7 331 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usf1Q61069 310 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sel1l3Q80TS8 1137 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc47a1Q8K0H1 567 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1512Q8VF72 313 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smap1Q91VZ6 440 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DgkgQ91WG7 788 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tex19.1Q99MV2 351 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nacc2Q9DCM7 586 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AnkhQ9JHZ2 492 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lhx6Q9R1R0 363 aa20.74■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6351K9J7D1 481 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stxbp1O08599 594 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rem1O35929 297 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il2raP01590 268 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp935Q14DI0 353 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrriq3Q14DL3 633 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dag1Q62165 893 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdhga7Q6DD96 935 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Echs1Q8BH95 290 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Clec4gQ8BNX1 294 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sall4Q8BX22 1067 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rdh13Q8CEE7 334 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdkl1Q8CEQ0 352 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim31Q8R0K2 507 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FggQ8VCM7 436 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr53Q8VGL8 312 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abhd17aQ99JW1 310 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nme5Q99MH5 211 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam136aQ9CR98 138 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sae1Q9R1T2 350 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa20.73■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc25a54B1AUS6 473 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Izumo4D3Z690 227 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm2056J3QQ02 144 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr237-ps1K9J725 310 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Elovl3O35949 271 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TfamP40630 243 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q32M26 199 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgap44Q5SSM3 814 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gpr39Q5U431 456 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sdc3Q64519 442 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Grm7Q68ED2 915 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zcchc4Q8BKW4 512 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc26a9Q8BU91 790 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rmnd1Q8CI78 450 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Iglon5Q8HW98 336 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dclre1cQ8K4J0 705 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc29a4Q8R139 528 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ntmt1Q8R2U4 223 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr812Q8VG64 310 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdhga12Q91XY7 932 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nt5c1bQ91YE9 573 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Grip1Q925T6 1127 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Yipf2Q99LP8 312 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pink1Q99MQ3 580 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem35aQ9D328 167 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lypd6bQ9D7F2 191 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TcimQ9D915 106 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp4f14Q9EP75 524 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adat1Q9JHI2 499 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cul3Q9JLV5 768 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dbf4Q9QZ41 663 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Khdrbs2Q9WU01 349 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rbck1Q9WUB0 508 aa20.72■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ap1g2O88512 791 aa20.71■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P06324 132 aa20.71■□□□□ 0.91
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map3k7clP58500 142 aa20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.5 ms