RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo15aQ9QZZ4 3511 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm28729A0A1B0GSW2 409 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm19965J3QNY8 723 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6337K7N6X9 211 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3115L7N285 211 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DbtP53395 482 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MybphP70402 483 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl10lP86048 214 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnj8P97794 424 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudt18Q3U2V3 323 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem247Q497K7 211 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armc5Q5EBP3 926 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc10a7Q5PT53 340 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PdprQ7TSQ8 878 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekho2Q8K124 495 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CenpiQ8K1K4 746 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ing3Q8VEK6 421 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr315Q8VFG7 309 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr535Q8VGL3 312 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc15a4Q91W98 574 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arrb2Q91YI4 410 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PglsQ9CQ60 257 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itgb3bpQ9CQ82 176 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OoepQ9CWE6 164 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yif1bQ9CX30 311 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sohlh2Q9D489 467 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scamp4Q9JKV5 230 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a13Q9QXX4 676 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpc6Q9R087 555 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc7Q9Z0H0 564 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f21A0A140T8Q5 498 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifi213D3Z5G0 586 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galnt9G3X942 604 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f22J3QN64 498 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd17b10O08756 261 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MndaP0DOV1 425 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 F9P16294 471 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PahP16331 453 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 F2P19221 618 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrg2P56974 756 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rin3P59729 980 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NfycP70353 335 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bpifa1P97361 278 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pou1f1Q00286 291 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DgkbQ6NS52 802 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Heatr6Q6P1G0 1184 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3c3Q6PF93 887 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1418Q7TQS3 318 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rap2aQ80ZJ1 183 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb42Q811H0 420 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a15Q8BG16 729 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem108Q8BHE4 574 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm45Q8BHN5 476 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbl3Q8C4J7 801 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gatad2aQ8CHY6 629 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LctlQ8K1F9 566 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r87Q8R255 295 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Retreg1dQ8VE91 480 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cbr4Q91VT4 236 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Man2c1Q91W89 1039 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dsn1Q9CYC5 348 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex47Q9D5W8 253 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smim23Q9DAL0 136 aa12.16□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lama1P19137 3084 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FrylF8VQ05 3007 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC024063A0A1W2P7G7 749 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trgv2A2J008 116 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr543E9PWI5 336 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6811E9Q3Y8 510 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5724L7N264 670 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elovl3O35949 271 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnpda1O88958 289 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp1a1P00184 524 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chrm4P32211 479 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabarapl2P60521 117 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps3aP97351 264 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptpn2Q06180 406 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr381Q5SSP0 311 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1364Q5SZS9 314 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf32Q80V23 272 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BpifcQ8C186 509 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb20Q8K0L9 741 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc38a4Q8R1S9 547 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf8Q8VC56 488 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcg4Q91WA9 646 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mto1Q923Z3 669 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim12aQ99PQ1 284 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MispQ9D279 648 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amdhd1Q9DBA8 426 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lman2Q9DBH5 358 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GabarapQ9DCD6 117 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elovl2Q9JLJ4 292 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn8Q9Z260 225 aa12.15□□□□□ -0.46
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10800D3Z496 220 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap40E9Q6X9 672 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ces2hF6Z9B9 558 aa12.15□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a11P31650 627 aa12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42 ms