RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000024620.6

Chd1-201, Transcript of Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Chd1, Length 3,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1-201ENSMUST00000024620 Xylt1Q811B1 953 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Hspbap1Q8BK58 483 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 MastlQ8C0P0 865 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Bcas3Q8CCN5 928 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Gpn1Q8VCE2 372 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Pcdha11Q91Y19 950 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 TpbpbQ9CQC0 121 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Pgam1Q9DBJ1 254 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Mpp6Q9JLB0 553 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Tmeff2Q9QYM9 374 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Med20Q9R0X0 212 aa9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Atad5Q4QY64 1826 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Gm31371A0A1D5RM70 265 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Trim30bE9PVL6 203 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Maml2F6U238 1170 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Gm2075J3QMW5 144 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Gm3099J3QPA5 205 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 TpmtO55060 240 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 GypaP14220 168 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Man2a1P27046 1150 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Gpr3P35413 330 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Rims4P60191 269 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Tbx6P70327 436 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Gdf10P97737 476 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Rhox4fQ2MDF8 205 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Rhox4cQ2MDG1 205 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Kcnh6Q32ME0 950 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Faf2Q3TDN2 445 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Mettl7a2Q5I0W6 244 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Cnih3Q6ZWS4 160 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Igsf5Q7TSN7 370 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Trmt61aQ80XC2 290 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Scn3bQ8BHK2 215 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Znf2Q8BIQ3 427 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Pnma1Q8C1C8 353 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Mettl7a1Q8C6B0 244 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Trnt1Q8K1J6 434 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Atat1Q8K341 421 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Commd1Q8K4M5 188 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Shisa2Q8QZV2 295 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Ace2Q8R0I0 805 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Olfr846Q8VET8 312 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 D10Jhu81eQ9D172 266 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Rhox4aQ9D3I8 205 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Chmp2aQ9DB34 222 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Ccdc107Q9DCC3 242 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Mettl9Q9EPL4 318 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 TollipQ9QZ06 274 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Lrrc73B2RWC4 316 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Pdzd8B9EJ80 1147 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Vmn2r17E9PYF5 849 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 LplP11152 474 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Fabp1P12710 127 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Tal1P22091 329 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Stard6P59096 233 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 LxnP70202 222 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Taf1aP97357 453 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Mtf1Q07243 675 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Bcl2a1cQ0P538 128 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Atf7ip2Q3UL97 452 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Gpr165Q3V3A3 455 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Ltc4sQ60860 150 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 KdsrQ6GV12 332 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Slc16a9Q7TM99 508 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Olfr1087Q7TR63 313 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Q80Y39 304 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Ing4Q8C0D7 249 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Fam20bQ8VCS3 409 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 MlycdQ99J39 492 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Sntb1Q99L88 537 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Ndufa2Q9CQ75 99 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Praf2Q9JIG8 178 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Il22bQ9JJY8 179 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Rhbdl2A2AGA4 302 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Gm3095E9Q058 166 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Rhox2gL7MUB9 191 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Slc16a8O35308 492 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Abcb1bP06795 1276 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Syt4P40749 425 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 CenptQ3TJM4 515 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 TepsinQ3U3N6 573 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Elmod1Q3V1U8 326 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Scn2bQ56A07 215 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Spdye4aQ5IBH6 268 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Vezf1Q5SXC4 518 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Dnajc11Q5U458 559 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Aldh3b1Q80VQ0 468 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Slc35e1Q8CD26 409 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Slc16a13Q8CE94 428 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 CenpoQ8K015 298 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Tram1l1Q8QZR0 363 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Vmn1r228Q8R2A7 333 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Slc35f5Q8R314 524 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Man2c1Q91W89 1039 aa9.59□□□□□ -0.87
Chd1-201ENSMUST00000024620 Slc26a5Q99NH7 744 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 232.4 ms