RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 MRGBPQ9NV56 204 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL4Q9UKA2 621 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SRPK3Q9UPE1 567 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0J9YY10 115 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SOCS6O14544 535 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL41O60662 606 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SHMT2P34897 504 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2D4BQ5SQS7 431 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 COX15Q7KZN9 410 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM20CQ8IXL6 584 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC34A3Q8N130 599 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 RILPQ96NA2 401 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 FOPNLQ96NB1 174 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF382Q96SR6 550 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 DCHS2Q6V1P9 2916 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TAPBPO15533 448 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRTM2O43300 516 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ESRRBO95718 433 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CD63P08962 238 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP11P24347 488 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB3P29508 390 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT72Q14CN4 511 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TBCCQ15814 346 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2A13Q16696 494 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT3A2Q3SY77 523 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GRHL3Q8TE85 626 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ATL1Q8WXF7 558 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SPSB2Q99619 263 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6C2Q9NZP2 312 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CATP04040 527 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH13P55290 713 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPC4APQ8TEL6 797 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 AGAP11Q8TF27 550 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 NACC2Q96BF6 587 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL8Q96CD0 374 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC138Q96M89 665 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 EBF4Q9BQW3 602 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MENTQ9BUN1 341 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MEAF6Q9HAF1 191 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCL2Q9UPR0 1127 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ASF1AQ9Y294 204 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-216ENST00000628306 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 AZIN1O14977 448 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 STK16O75716 305 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA3P26006 1051 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 AGTR2P50052 363 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 KIRREL2Q6UWL6 708 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAD11Q709F0 780 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5K2Q8NHB8 316 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP10Q96AY3 582 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ERP27Q96DN0 273 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 EGFL8Q99944 293 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MESP1Q9BRJ9 268 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL15Q9NXU5 204 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ENTPD4Q9Y227 616 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 OSGIN2Q9Y236 505 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL20Q9Y2M5 609 aa22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 K7EPI3 171 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 FCHO1O14526 889 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 DIAPH2O60879 1101 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 UBOX5O94941 541 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 Q0VFX4 171 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NKG7Q16617 165 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 KANK2Q63ZY3 851 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF165Q6ZSG1 346 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 OVCH1Q7RTY7 1134 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01555Q8NAE3 123 aa22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms