RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR33A8MZF0 331 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 HCRTR1O43613 425 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SCN2BO60939 215 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMP1P11279 417 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CD1CP29017 333 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB8AP61006 207 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CPTPQ5TA50 214 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRED1Q7Z699 444 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CARFQ8N187 725 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 EID2Q8N6I1 236 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 RMND5AQ9H871 391 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 URADA6NGE7 173 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 RASSF9O75901 435 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE5AO76074 875 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SCELO95171 688 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNH1O95259 989 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 C9P02748 559 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A2P23975 617 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 KLC1Q07866 573 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G2CQ5R387 149 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PLXDC1Q8IUK5 500 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT4Q8N9L9 421 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8K5Q8NH50 307 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB8Q8NHS0 232 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP26Q9BV47 211 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNH6Q9H252 994 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCD2Q9UBJ2 740 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB23Q9ULC3 237 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 A8MUI8 341 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PLIN5Q00G26 463 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CEACAM7Q14002 265 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 AMZ1Q400G9 498 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF385BQ569K4 471 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 GUSBP11Q6P575 273 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 HPS6Q86YV9 775 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA2013Q8IYS2 634 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ITCHQ96J02 903 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ADA2Q9NZK5 511 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PACSIN3Q9UKS6 424 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX19O60806 448 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GALT4O96024 378 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM58BPP0C7Q3 252 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CSF2RBP32927 897 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRA4P48169 554 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A2P52569 658 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9A5Q14940 896 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 HEPACAMQ14CZ8 416 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf10Q5SRN2 563 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 LRIF1Q5T3J3 769 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEAL6Q6IPX3 200 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC15A3Q8IY34 581 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CSNK1A1LQ8N752 337 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB14Q8TBM8 379 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEAL3Q969E4 200 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CGREF1Q99674 301 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3BP4Q9P0V3 963 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa23.64■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ERN1O75460 977 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 DDCP20711 480 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 CERS1P27544 350 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 BTN3A2P78410 334 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SLAMF1Q13291 335 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 SQSTM1Q13501 440 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB110Q30KQ9 67 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-215ENST00000628018 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.64■■□□□ 1.37
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