RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 PARP15Q460N3 678 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SUN5Q8TC36 379 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TP53INP1Q96A56 240 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SLC39A13Q96H72 371 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 IGSF21Q96ID5 467 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ASPNQ9BXN1 380 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CD244Q9BZW8 370 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLN6Q9NWW5 311 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FZD4Q9ULV1 537 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KLK8O60259 260 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 B4GALT3O60512 393 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FGF18O76093 207 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 AP2A2O94973 939 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLDN9O95484 217 aa6.69□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 ESR1P03372 595 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SOD2P04179 222 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LAMP1P11279 417 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PTPN2P17706 415 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 HTR7P34969 479 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NRIP1P48552 1158 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SGSHP51688 502 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CAV3P56539 151 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GPLD1P80108 840 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 RBFAQ8N0V3 343 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KCNH6Q9H252 994 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.69□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.69□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 MTMR11A4FU01 709 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 OR2AG2A6NM03 316 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 AKR7A2O43488 359 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PCDH7O60245 1069 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLDN7O95471 211 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 EPOP01588 193 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 HPGDP15428 266 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PTGER3P43115 390 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GSTM5P46439 218 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CAPZA2P47755 286 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CXCR4P61073 352 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 HOXC5Q00444 222 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 STX4Q12846 297 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GPM6BQ13491 265 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NAE1Q13564 534 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DOC2BQ14184 412 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SLC9A5Q14940 896 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CDK10Q15131 360 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.343e-6■■■■□ 20.8
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NEDD9-216ENST00000620854 NAGSQ8N159 534 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SUSD6Q92537 303 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 COQ8BQ96D53 544 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C8orf48Q96LL4 319 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TRIB3Q96RU7 358 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MKLN1Q9UL63 735 aa6.69□□□□□ -1.34
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