RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A14Q9Y267 594 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ZFHX3Q15911 3703 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 C4orf51C9J302 202 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 TFECO14948 347 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN3P20807 821 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PTGS2P35354 604 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 TMPRSS11BQ86T26 416 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 B3GNT7Q8NFL0 401 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SDCCAG3Q96C92 435 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 MMACHCQ9Y4U1 282 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 KCNE2Q9Y6J6 123 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GTH9 108 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 PEX1O43933 1283 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CLCN2P51788 898 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TERF2Q15554 542 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf52Q8NHV5 167 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 FAM57AQ8TBR7 257 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 COQ3Q9NZJ6 369 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 MYO1DO94832 1006 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 RFC3P40938 356 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CMPK2Q5EBM0 449 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CHTF18Q8WVB6 975 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD7Q92527 254 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 HRH3Q9Y5N1 445 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CDC7O00311 574 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 HS6ST1O60243 411 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 ITGA10O75578 1167 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 IVDP26440 423 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 ELK3P41970 407 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 BTN3A2P78410 334 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 MDGA2Q7Z553 956 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CD163Q86VB7 1156 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 SCUBE1Q8IWY4 988 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM156Q8N614 296 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO2A1Q92959 643 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP36Q96G28 342 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 MCCC2Q9HCC0 563 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 FBXW2Q9UKT8 454 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TPOP07202 933 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TFEBP19484 476 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 GPR143P51810 404 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CDKL1Q00532 357 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TLE4Q04727 773 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 RUNX2Q13950 521 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TESK1Q15569 626 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 STEAP4Q687X5 459 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 PDIK1LQ8N165 341 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 MARVELD2Q8N4S9 558 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 VMP1Q96GC9 406 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 PLSCR2Q9NRY7 297 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN16Q9Y5I7 305 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 MTORP42345 2549 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.318e-7■■□□□ 14.2
PTPRF-216ENST00000617451 HNMTP50135 292 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 GAL3ST3Q96A11 431 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 FAR2Q96K12 515 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 PWWP2AQ96N64 755 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 SPG11Q96JI7 2443 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TGFBR3LH3BV60 316 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CES2O00748 559 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 GNAZP19086 355 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 PPP2R1BP30154 601 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 HSD17B7P56937 341 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 GPR85P60893 370 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 MORF4L2Q15014 288 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 CDH24Q86UP0 819 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35F6Q8N357 371 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRF-216ENST00000617451 TTLQ8NG68 377 aa23.21■■□□□ 1.31
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