RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HACD4Q5VWC8 232 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MITD1Q8WV92 249 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MYOCQ99972 504 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP26Q9BV47 211 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ACP6Q9NPH0 428 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ASB4Q9Y574 426 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ADRA1BP35368 520 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CHAF1BQ13112 559 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GAS6Q14393 721 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ESCO2Q56NI9 601 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MATN3O15232 486 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-HP01893 362 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RHOQP17081 205 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RAB4BP61018 213 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FGL2Q14314 439 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GPR149Q86SP6 731 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ADAM2Q99965 735 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 EBPLQ9BY08 206 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LRCH4O75427 683 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 POU2F1P14859 743 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf29Q8N999 325 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 STUB1Q9UNE7 303 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TIMM22Q9Y584 194 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CACNA1SQ13698 1873 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 J3QRK9 145 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NPC1O15118 1278 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RFPL2O75678 378 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CD3GP09693 182 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CCR8P51685 355 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GALK2Q01415 458 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF33AQ06730 810 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ECH1Q13011 328 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC66Q68CR7 880 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TAAR8Q969N4 342 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FBXL8Q96CD0 374 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RNF32Q9H0A6 362 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PSMD9O00233 223 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PRAF2O60831 178 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 EDNRAP25101 427 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NUMBP49757 651 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MAXP61244 160 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK-16P61578 105 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CXCL11O14625 94 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR2B3O76000 313 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LYPLA2O95372 231 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PITPNBP48739 271 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJB13P59910 316 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM199Q8N511 208 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TSPEARQ8WU66 669 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR4K3Q96R72 315 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.76□□□□□ -1.33
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