RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ATL1Q8WXF7 558 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PELI2Q9HAT8 420 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFATQ9P243 1243 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NF1P21359 2839 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC13O75165 2243 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NKX2-6A6NCS4 301 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 USP27XA6NNY8 438 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGA10O75578 1167 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO1DO94832 1006 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC4O95801 387 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 AHSGP02765 367 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINA6P08185 405 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CD1EP15812 388 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MSX1P28360 303 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PGGT1BP53609 377 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR85P60893 370 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SBSNQ6UWP8 590 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CA13Q8N1Q1 262 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RND1Q92730 232 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 VMP1Q96GC9 406 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 UCK2Q9BZX2 261 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 AICDAQ9GZX7 198 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RHBGQ9H310 441 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL31Q9H511 634 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 DEPPQ9NTK1 212 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF6Q9Y252 685 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MTORP42345 2549 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SPG11Q96JI7 2443 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE9AO76083 593 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TOXO94900 526 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBB4AP04350 444 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SSR4P51571 173 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR143P51810 404 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 EMC4Q5J8M3 183 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PAOXQ6QHF9 649 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 GPATCH11Q8N954 259 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NCLNQ969V3 563 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CERS2Q96G23 380 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MS4A14Q96JA4 679 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNJ16Q9NPI9 418 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 EML6Q6ZMW3 1958 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PINLYPA6NC86 204 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MVJ9 347 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 BANF1O75531 89 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFAND5O76080 213 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP2R1BP30154 601 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ART1P52961 327 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 HSD17B7P56937 341 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 NUP107P57740 925 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms