RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC6A11P48066 632 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ARFIP1P53367 373 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 CDH15P55291 814 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 GPLD1P80108 840 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 DMPKQ09013 629 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 KCNAB2Q13303 367 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 HKDC1Q2TB90 917 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF691Q5VV52 312 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 METRNLQ641Q3 311 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PNCKQ6P2M8 343 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 FAHD1Q6P587 224 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 HORMAD1Q86X24 394 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 LZICQ8WZA0 190 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 SMPDL3AQ92484 453 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 FGF13Q92913 245 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PPCDCQ96CD2 204 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ISOC1Q96CN7 298 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 APOL4Q9BPW4 351 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 DOHHQ9BU89 302 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 TEX101Q9BY14 249 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 REEP1Q9H902 201 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 RMI1Q9H9A7 625 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 FBRSQ9HAH7 460 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 FZD4Q9ULV1 537 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ICKQ9UPZ9 632 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.89□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 E9PQ18 207 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 J3QW42 95 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 K7ESM1 405 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 BCKDKO14874 412 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ADAMDEC1O15204 470 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 HS6ST1O60243 411 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 AVPP01185 164 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 C9P02748 559 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ITIH1P19827 911 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 C5AR1P21730 350 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 FCARP24071 287 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 SHMT2P34897 504 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 OPRD1P41143 372 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 CCR8P51685 355 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 ISL1P61371 349 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 CDK3Q00526 305 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 TEKQ02763 1124 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 MVKQ03426 396 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 CNTN1Q12860 1018 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC14A1Q13336 389 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 RUNX3Q13761 415 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 SPIDRQ14159 915 aa6.88□□□□□ -1.31
EFTUD2-208ENST00000587914 RAB39AQ14964 217 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms