RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	E2F3	O00716	465 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	STX16	O14662	325 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	DNAJB6	O75190	326 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SERPINA7	P05543	415 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRR35	P0CG20	571 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TGM3	Q08188	693 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	NADK2	Q4G0N4	442 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TEX35	Q5T0J7	233 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	LIPJ	Q5W064	366 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MED27	Q6P2C8	311 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TEX9	Q8N6V9	391 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2L5	Q8NG80	312 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCT6B	Q92526	530 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAR2	Q96K12	515 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC77	Q9BR77	488 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF358	Q9NW07	568 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	C4orf51	C9J302	202 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	B3GALT4	O96024	378 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MYBL2	P10244	700 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	OLR1	P78380	273 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	BTN3A2	P78410	334 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	GTF2H2	Q13888	395 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	NSDHL	Q15738	373 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC6A19	Q695T7	634 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CA13	Q8N1Q1	262 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR7G3	Q8NG95	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	QRFPR	Q96P65	431 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SERINC2	Q96SA4	455 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPCS	Q9HAB8	311 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	XPR1	Q9UBH6	696 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2W5	A6NFC9	320 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501		H0YIV9	168 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	B3GALT2	O43825	422 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRMT3	O60678	531 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	SMIM24	O75264	130 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	PIK3CB	P42338	1070 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLA2G16	P53816	162 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	MLLT10	P55197	1068 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	MFAP5	Q13361	173 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	EXT1	Q16394	746 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501		Q6ZS92	163 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501		Q8NA96	180 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	PSMF1	Q92530	271 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	SCYL1	Q96KG9	808 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	KCNC2	Q96PR1	638 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	MS4A8	Q9BY19	250 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	IPPK	Q9H8X2	491 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms