RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575857.3

SLC12A4-215, Transcript of solute carrier family 12 member 4, human

TSL 3

Gene SLC12A4, Length 588 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC12A4-215	ENST00000575857	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	FRG2	Q64ET8	278 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ABHD13	Q7L211	337 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CCT6B	Q92526	530 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	REPS1	Q96D71	796 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	FRG2B	Q96QU4	278 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	OR51B5	Q9H339	312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857		A0A0G2JN53	185 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857		B8ZZF3	427 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857		H3BQF6	201 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	MANBA	O00462	879 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	BIRC5	O15392	142 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	NPHS1	O60500	1241 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	BMP10	O95393	424 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	UQCRH	P07919	91 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CD63	P08962	238 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	HTR6	P50406	440 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	PLA2G16	P53816	162 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	FOXA1	P55317	472 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CDC20	Q12834	499 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CUL3	Q13618	768 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	RUNX2	Q13950	521 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	UGT8	Q16880	541 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	VWA2	Q5GFL6	755 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CFAP157	Q5JU67	520 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	MED25	Q71SY5	747 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CNDP1	Q96KN2	507 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	KCNA7	Q96RP8	456 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	TRMO	Q9BU70	441 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	SERTM1	A2A2V5	107 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	PLPP1	O14494	284 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CHST10	O43529	356 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	SLC28A2	O43868	658 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	SH3BGRL	O75368	114 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	JRK	O75564	520 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	SEMA3D	O95025	777 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	PDYN	P01213	254 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CHRNG	P07510	517 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	FOLR3	P41439	243 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ARFIP1	P53367	373 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	OLR1	P78380	273 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	BTN3A2	P78410	334 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	MC1R	Q01726	317 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	KLC1	Q07866	573 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	ASPH	Q12797	758 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	IFT88	Q13099	833 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	RCN2	Q14257	317 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	SSPN	Q14714	243 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	CHSY3	Q70JA7	882 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SLC12A4-215	ENST00000575857	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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