RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	COQ7	Q99807	217 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZPBP	Q9BS86	351 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	RUBCNL	Q9H714	662 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	UBP1	Q9NZI7	540 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984		B8ZZF3	427 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	AP3B1	O00203	1094 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SNX2	O60749	519 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KCNJ13	O60928	360 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KCNK2	O95069	426 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	IGHA1	P01876	353 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	APOC2	P02655	101 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	BMP4	P12644	408 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	NAGA	P17050	411 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CTRB1	P17538	263 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	HLA-DPA1	P20036	260 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	HLCS	P50747	726 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SLC13A2	Q13183	592 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TUBA3C	Q13748	450 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	NOMO1	Q15155	1222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	XAF1	Q6GPH4	301 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	FAM110B	Q8TC76	370 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	FIG4	Q92562	907 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	HTRA1	Q92743	480 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	VPS33A	Q96AX1	596 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	FKBP10	Q96AY3	582 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	RTP4	Q96DX8	246 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	VMP1	Q96GC9	406 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MARK4	Q96L34	752 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	LHPP	Q9H008	270 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SP140L	Q9H930	580 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	IL26	Q9NPH9	171 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	HAT1	O14929	419 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	RAD1	O60671	282 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MTX2	O75431	263 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CDK14	O94921	469 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SLC4A1	P02730	911 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MSL3P1	P0C860	447 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	RALB	P11234	206 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	S100A5	P33763	92 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CA5A	P35218	305 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SPAM1	P38567	509 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CHRNA4	P43681	627 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CBLB	Q13191	982 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ART3	Q13508	389 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KCNJ11	Q14654	390 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TBR1	Q16650	682 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	INSC	Q1MX18	579 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ANKS6	Q68DC2	871 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PID1	Q7Z2X4	250 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CYGB	Q8WWM9	190 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	LPGAT1	Q92604	370 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PEX13	Q92968	403 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MAP6	Q96JE9	813 aa		6.23	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	NPAS2	Q99743	824 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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