RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532181.5

SSH3-208, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, human

TSL 3

Gene SSH3, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSH3-208	ENST00000532181	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MECR	Q9BV79	373 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	WDR54	Q9H977	334 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ARGFX	A6NJG6	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181		H0YIV9	168 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	SUPT7L	O94864	414 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CLDN9	O95484	217 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ALDH3A1	P30838	453 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	FOLR3	P41439	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ETV4	P43268	484 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	XCR1	P46094	333 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CCT5	P48643	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	HTR6	P50406	440 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	NAGLU	P54802	743 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	FOXA1	P55317	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	BTG2	P78543	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	RGS1	Q08116	209 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	LAPTM5	Q13571	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	UCN3	Q969E3	161 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MIEF2	Q96C03	454 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	KCNA7	Q96RP8	456 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	OXSM	Q9NWU1	459 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	IDS	B3KWA1	339 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	UGDH	O60701	494 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	EED	O75530	441 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MYL2	P10916	166 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TAC1	P20366	129 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MMP11	P24347	488 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CERS1	P27544	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	AVPR1B	P47901	424 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CCL11	P51671	97 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CCNG1	P51959	295 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	RHAG	Q02094	409 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CASP8	Q14790	479 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	HERC3	Q15034	1050 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	SGO1	Q5FBB7	561 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TTL	Q8NG68	377 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	TSLP	Q969D9	159 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	HBEGF	Q99075	208 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	C3orf18	Q9UK00	162 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PLPP1	O14494	284 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	PDYN	P01213	254 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CELA2A	P08217	269 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	SERPINB3	P29508	390 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	BSG	P35613	385 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SSH3-208	ENST00000532181	CASR	P41180	1078 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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