RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BIRC3Q13489 604 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYMQ14894 314 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPNMBQ14956 572 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC14Q49A88 953 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB41Q5JT25 222 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 REP15Q6BDI9 236 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGFL1Q6UW32 110 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DHRS11Q6UWP2 260 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q71RC1 249 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIGWQ7Z7B1 504 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00346Q8IVM7 164 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM61Q8N0U2 210 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF781Q8N8C0 355 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10S1Q8NGN2 331 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP61Q8NHU2 1237 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF671Q8TAW3 534 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PROX1Q92786 737 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SGF29Q96ES7 293 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C7orf26Q96N11 449 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MUS81Q96NY9 551 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERINC2Q96SA4 455 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL12RB2Q99665 862 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPNE1Q99829 537 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRRG4Q9BZD6 226 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SDCBP2Q9H190 292 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTL8Q9H568 366 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNK13Q9HB14 408 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C3orf14Q9HBI5 128 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRODH2Q9UF12 536 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MGAT4AQ9UM21 535 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COMMD10Q9Y6G5 202 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF123Q5XPI4 1314 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa0.33□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTDSP2O14595 271 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF5CO60282 957 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGR2O95994 175 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MT-ND2P03891 347 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YES1P07947 543 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR9G9P0C7N8 305 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DLATP10515 647 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SKILP12757 684 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGAM2P15259 253 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS2P15880 293 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRKAR2BP31323 418 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAGEA9P43362 315 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FNTAP49354 379 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC12A3P55017 1021 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PFN3P60673 137 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPB3Q12988 150 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCLAFQ15004 111 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGD3Q5JSP0 725 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASPHD2Q6ICH7 369 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAX1Q8IWV1 398 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC39CQ8N584 583 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC01555Q8NAE3 123 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIPHQ8WWY8 451 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EXOC4Q96A65 974 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MOB3AQ96BX8 217 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCLT1Q96NL6 688 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CASD1Q96PB1 797 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PINK1Q9BXM7 581 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF702PQ9H963 129 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HPS4Q9NQG7 708 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF221Q9UK13 617 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSG11Q9UQ72 335 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF24Q9Y225 148 aa0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGAP14A8MT82 685 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCF2LO15068 1137 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USO1O60763 962 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B4GALT2O60909 372 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STBD1O95210 358 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAMP1P11279 417 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBPP20226 339 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SFTPDP35247 375 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CETN2P41208 172 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC1A6P48664 564 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAV2P51636 162 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF131P52739 623 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLDN17P56750 224 aa0.31□□□□□ -2.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCP2Q13094 533 aa0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms