RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CEP97Q8IW35 865 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 FBXO36Q8NEA4 188 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 AGAP11Q8TF27 550 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 FAR2Q96K12 515 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PHF12Q96QT6 1004 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 MOCS1Q9NZB8 636 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.81■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 APCP25054 2843 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 FCHO1O14526 889 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TP73O15350 636 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 MYO1DO94832 1006 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CLDN14O95500 239 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 GNAZP19086 355 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CLCN2P51788 898 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 RUNX2Q13950 521 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 C3P1Q6ZMU1 363 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.8■□□□□ 0.12
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HERC3-211ENST00000513325 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 DOLPP1Q86YN1 238 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CREG2Q8IUH2 290 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CCT6BQ92526 530 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 RUNDC3BQ96NL0 473 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TRIM31Q9BZY9 425 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 GPAMQ9HCL2 828 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 ASB1Q9Y576 335 aa15.8■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PCNX1Q96RV3 2341 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 LRIT2A6NDA9 550 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
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HERC3-211ENST00000513325 SLC6A12P48065 614 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 MEOX1P50221 254 aa15.79■□□□□ 0.12
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HERC3-211ENST00000513325 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.79■□□□□ 0.12
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HERC3-211ENST00000513325 VPS39Q96JC1 886 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 LURAP1Q96LR2 239 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 RHOJQ9H4E5 214 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CSMD1Q96PZ7 3565 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 E7ESA3 106 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 E9PLN8 166 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TGFBR3LH3BV60 316 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PRRG2O14669 202 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 ADAM10O14672 748 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 ITGA10O75578 1167 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PIAS1O75925 651 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R1BP30154 601 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TERF2Q15554 542 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TGFBIQ15582 683 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 KRT78Q8N1N4 520 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 SPATA6LQ8N4H0 392 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TMEM156Q8N614 296 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TMEM52Q8NDY8 209 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 TTLQ8NG68 377 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 VMP1Q96GC9 406 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 FBN2P35556 2912 aa15.78■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 USP27XA6NNY8 438 aa15.77■□□□□ 0.12
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB8A8MWE9 144 aa15.77■□□□□ 0.12
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