RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 PHEXP78562 749 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 IFT88Q13099 833 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 MLIPQ5VWP3 458 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF425Q6IV72 752 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 LETMD1Q6P1Q0 360 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 MED25Q71SY5 747 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM73Q86UV7 250 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 PAQR7Q86WK9 346 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 RAB43Q86YS6 212 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 FAM20CQ8IXL6 584 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF781Q8N8C0 355 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 THAP11Q96EK4 314 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 TCTN2Q96GX1 697 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 SEC16BQ96JE7 1060 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 CCT7Q99832 543 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 NUDT9Q9BW91 350 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 ELOVL6Q9H5J4 265 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 SLC6A20Q9NP91 592 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 GPR83Q9NYM4 423 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF225Q9UK10 706 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 SH2B3Q9UQQ2 575 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 PADI2Q9Y2J8 665 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa10.78□□□□□ -0.68
UBE2B-208ENST00000511807 NAV2Q8IVL1 2488 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ANKDD1BA6NHY2 528 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 OR1F1O43749 312 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PRAMEF4O60810 478 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 OR2B3O76000 313 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TGDSO95455 350 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 HBQ1P09105 142 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MSL3P1P0C860 447 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 KITP10721 976 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 EZRP15311 586 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 AHRP35869 848 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 YBX1P67809 324 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 REEP5Q00765 189 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DEFB110Q30KQ9 67 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf189Q5VU69 101 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 KANK2Q63ZY3 851 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FRG2Q64ET8 278 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SLC6A19Q695T7 634 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 LAS2Q8IYD9 372 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 AGR3Q8TD06 166 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FRG2BQ96QU4 278 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SARGQ9BW04 601 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FAM60AQ9NP50 221 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PNPOQ9NVS9 261 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 IRAK4Q9NWZ3 460 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL20Q9Y2M5 609 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FIS1Q9Y3D6 152 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TIMM22Q9Y584 194 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FLNCQ14315 2725 aa10.77□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GTL3 188 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FEZF1A0PJY2 475 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TRPC5OSA6NMA1 111 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MANBAO00462 879 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FFAR3O14843 346 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 HAT1O14929 419 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 HDAC3O15379 428 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 GPR42O15529 346 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SEMA7AO75326 666 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PCNAP12004 261 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CD22P20273 847 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PIK3CBP42338 1070 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SLC9A5Q14940 896 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FCRL6Q6DN72 434 aa10.76□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC6AQ6EIG7 209 aa10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms