RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 NECTIN3Q9NQS3 549 aa18.02■□□□□ 0.48
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SH3BP2-220ENST00000511663 FBXW2Q9UKT8 454 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-220ENST00000511663 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKDD1BA6NHY2 528 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TFECO14948 347 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO1DO94832 1006 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 GSTM2P28161 218 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 HYAL2Q12891 473 aa18.01■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R3AQ16821 1122 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SIAH3Q8IW03 269 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 GAL3ST3Q96A11 431 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa18.01■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 E9PLN8 166 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 B3GALT2O43825 422 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PAFAH1B1P43034 410 aa18■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO36Q8NEA4 188 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 VMP1Q96GC9 406 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SEC16BQ96JE7 1060 aa18■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM31Q9BZY9 425 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 CELSR2Q9HCU4 2923 aa18■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PTGS2P35354 604 aa17.99■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 ERVK-11Q9UQG0 969 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PSAT1Q9Y617 370 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0G2JN53 185 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 CTAGE15A4D2H0 777 aa17.98■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC188H7C350 402 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PEX1O43933 1283 aa17.98■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SSTR2P30874 369 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SSR4P51571 173 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB38P57729 211 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 BMPR2Q13873 1038 aa17.98■□□□□ 0.47
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 CTAGE6Q86UF2 777 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF595Q8IYB9 648 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 ARMC10Q8N2F6 343 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 BBOF1Q8ND07 529 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 CDKL2Q92772 493 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 RHBDF1Q96CC6 855 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 MS4A6EQ96DS6 147 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPAN17Q96FV3 270 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-220ENST00000511663 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
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