RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.09■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 ERI3O43414 337 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 WISP2O76076 250 aa23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 SSTR1P30872 391 aa23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 KRTCAP3Q53RY4 240 aa23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 MRGPRGQ86SM5 289 aa23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 SEC16BQ96JE7 1060 aa23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM79Q9BSE2 394 aa23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 DPH5Q9H2P9 285 aa23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 SAYSD1Q9NPB0 183 aa23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ALYREF-203ENST00000511412 MYO7BQ6PIF6 2116 aa23.08■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 A0A088AWK7 358 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 A0A0G2JN53 185 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 FAM187AA6NFU0 413 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 A8MUA0 341 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 NPIPA5E9PKD4 350 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 FCHO1O14526 889 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 FANCGO15287 622 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 NME2P1O60361 137 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 NME2P22392 152 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 CYB561P49447 251 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 MLF1P58340 268 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 MAPKAPK3Q16644 382 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 MS4A6EQ96DS6 147 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 CPNE1Q99829 537 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 DEFB126Q9BYW3 111 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 WHRNQ9P202 907 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 TINAGQ9UJW2 476 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 NPIPA1Q9UND3 350 aa23.07■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 MYO9AB2RTY4 2548 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
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ALYREF-203ENST00000511412 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 RAB38P57729 211 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 C3AR1Q16581 482 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 GPSM1Q86YR5 675 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 SCUBE1Q8IWY4 988 aa23.06■■□□□ 1.28
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ALYREF-203ENST00000511412 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 GPR22Q99680 433 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 RBBP8Q99708 897 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 ERP44Q9BS26 406 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 EHD1Q9H4M9 534 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 NT5DC2Q9H857 520 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJC11Q9NVH1 559 aa23.06■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 LRIT2A6NDA9 550 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 ANKDD1BA6NHY2 528 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 ENO4A6NNW6 628 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 CLGNO14967 610 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 TAPBPO15533 448 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 B3GALT2O43825 422 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 CLEC3AO75596 197 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 MYO1DO94832 1006 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 CD1DP15813 335 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 STMN1P16949 149 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF24P17028 368 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 GGT5P36269 586 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 CLCN2P51788 898 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 ATP6V0D1P61421 351 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 RUNX2Q13950 521 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 TERF2Q15554 542 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM40Q6P9F5 258 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 SIAH3Q8IW03 269 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 APCDD1LQ8NCL9 501 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM125Q96AQ2 219 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF835Q9Y2P0 537 aa23.05■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa23.04■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa23.04■■□□□ 1.28
ALYREF-203ENST00000511412 CLDN4O14493 209 aa23.04■■□□□ 1.28
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