RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 SH3BGRLO75368 114 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLEC3AO75596 197 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 DNAJB5O75953 348 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ALOX12P18054 663 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 PTPN4P29074 926 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 SERPINB1P30740 379 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 DNAJB13P59910 316 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 RAB8AP61006 207 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 NAA20P61599 178 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 OCA2Q04671 838 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 PCDH1Q08174 1060 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 TGM3Q08188 693 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 LCP2Q13094 533 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 IFT88Q13099 833 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM53BQ14153 422 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 NADK2Q4G0N4 442 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 DEFB134Q4QY38 66 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 SGO1Q5FBB7 561 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 LIPMQ5VYY2 423 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 CHSY3Q70JA7 882 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ANKRD42Q8N9B4 389 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 L3MBTL4Q8NA19 623 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR4F6Q8NGB9 312 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR9A4Q8NGU2 314 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 L3HYPDHQ96EM0 354 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 MVB12AQ96EY5 273 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 SEC16BQ96JE7 1060 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 CENPKQ9BS16 269 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 NTMT1Q9BV86 223 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ACBD3Q9H3P7 528 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ACTL8Q9H568 366 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ELOVL6Q9H5J4 265 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMBIM4Q9HC24 238 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZBTB26Q9HCK0 441 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRPC4Q9UBN4 977 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 PADI2Q9Y2J8 665 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC22A7Q9Y694 548 aa10.4□□□□□ -0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A088AWK7 358 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 WDR91A4D1P6 747 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRIT2A6NDA9 550 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 WIPF3A6NGB9 483 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 TCP11X1B4DZS4 312 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 PPP6CO00743 305 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 TM9SF1O15321 606 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERI3O43414 337 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 TYROBPO43914 113 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 KLHL18O94889 574 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR4F21O95013 312 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZWINTO95229 277 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 MED26O95402 600 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 TGFB1P01137 390 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 RAB40ALP0C0E4 278 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 HMOX2P30519 316 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 ALDH3A1P30838 453 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 FOLR3P41439 243 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 GCGRP47871 477 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 RAP1GDS1P52306 607 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLA2G16P53816 162 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 RPS18P62269 152 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 BTN3A2P78410 334 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 DSG2Q14126 1118 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 PCLAFQ15004 111 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 NCF4Q15080 339 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 MFSD4BQ5TF39 518 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 HHATQ5VTY9 493 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADNP2Q6IQ32 1131 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRIM40Q6P9F5 258 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 OVCH1Q7RTY7 1134 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 NUDCD3Q8IVD9 361 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 LAS2Q8IYD9 372 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRSS58Q8IYP2 241 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 CDYL2Q8N8U2 506 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 HUS1BQ8NHY5 278 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 METTL6Q8TCB7 284 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 GAL3ST3Q96A11 431 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 CMTM7Q96FZ5 175 aa10.39□□□□□ -0.75
CD27-AS1-204ENST00000504270 F2RL3Q96RI0 385 aa10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms