RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	GJB2	P29033	226 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	DHODH	Q02127	395 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	STXBP2	Q15833	593 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	SGCB	Q16585	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802		Q6ZVQ6	151 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	GGH	Q92820	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802		G3V2L1	256 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802		K7EQD1	137 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	RNF224	P0DH78	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	PDHA2	P29803	388 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	GPR183	P32249	361 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	RNF103	O00237	685 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	CHUK	O15111	745 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	HMOX1	P09601	288 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ODC1	P11926	461 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ACKR3	P25106	362 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	UBXN1	Q04323	297 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	LCP2	Q13094	533 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	RPA4	Q13156	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SKAP2-208	ENST00000495802	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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