RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SYPP08247 313 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PRPS2P11908 318 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 JUPP14923 745 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MYF6P23409 242 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ELK4P28324 431 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 WASP42768 502 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MAPK10P53779 464 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ARSFP54793 590 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GTF2H3Q13889 308 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 STK11Q15831 433 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CYP2A13Q16696 494 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RGS21Q2M5E4 152 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NATD1Q8N6N6 113 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 BORCS5Q969J3 196 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 VMP1Q96GC9 406 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ITCHQ96J02 903 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PKP4Q99569 1192 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RMND5AQ9H871 391 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 EXD2Q9NVH0 621 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GSTM1P09488 218 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LAMP1P11279 417 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FOSL1P15407 271 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IMPA1P29218 277 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 AQP1P29972 269 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NTSR1P30989 418 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GPR1P46091 355 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NEDD8Q15843 81 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 UGT8Q16880 541 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HKDC1Q2TB90 917 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PROX2Q3B8N5 592 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DPPA4Q7L190 304 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CARFQ8N187 725 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NEIL2Q969S2 332 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ARRDC3Q96B67 414 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FBXL8Q96CD0 374 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FOPNLQ96NB1 174 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ING2Q9H160 280 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GULP1Q9UBP9 304 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 EVPLLA8MZ36 301 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 G3V2T6 193 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 J3QRK9 145 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FPGTO14772 594 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 YY2O15391 372 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ICMTO60725 284 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PRKACAP17612 351 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ENPP1P22413 925 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GDI1P31150 447 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SP140Q13342 867 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DAG1Q14118 895 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 USP43Q70EL4 1123 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TAMM41Q96BW9 452 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IL17FQ96PD4 163 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DEC1Q9P2X7 70 aa6.72□□□□□ -1.33
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