RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490417.6

SFXN4-208, Transcript of sideroflexin 4, human

TSL 2

Gene SFXN4, Length 952 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFXN4-208	ENST00000490417	HNF4A	P41235	474 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	GLRB	P48167	497 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	TAS2R50	P59544	299 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	RAB8A	P61006	207 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	IGFBP7	Q16270	282 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	BTBD16	Q32M84	506 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417		Q6ZS92	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	CHSY3	Q70JA7	882 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PDSS2	Q86YH6	399 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	M1AP	Q8TC57	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	NXNL1	Q96CM4	212 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	WDR34	Q96EX3	536 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	CNDP1	Q96KN2	507 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	VPS11	Q9H270	941 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	NBAS	A2RRP1	2371 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	LRIT2	A6NDA9	550 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	CASP2	P42575	452 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	KCNC1	P48547	511 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	OR4D2	P58180	307 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	BTN3A2	P78410	334 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	CHIT1	Q13231	466 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	BMPR2	Q13873	1038 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	DOC2A	Q14183	400 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PCOLCE	Q15113	449 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	MED27	Q6P2C8	311 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	OR2L5	Q8NG80	312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	MTBP	Q96DY7	904 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	MOCOS	Q96EN8	888 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	KCNC2	Q96PR1	638 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PAFAH2	Q99487	392 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	RHBG	Q9H310	441 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PLAA	Q9Y263	795 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	BLACE	A4D250	179 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	UBXN8	O00124	270 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	UGDH	O60701	494 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	B4GALT2	O60909	372 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	SMIM24	O75264	130 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	JRK	O75564	520 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ABHD2	P08910	425 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	MTTP	P55157	894 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	RELB	Q01201	579 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	PFKFB4	Q16877	469 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	SFT2D3	Q587I9	215 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	COLEC12	Q5KU26	742 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	LIPJ	Q5W064	366 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	MEIOB	Q8N635	442 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	SLC5A8	Q8N695	610 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	HAS2	Q92819	552 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	SERINC2	Q96SA4	455 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	RNF32	Q9H0A6	362 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	KCNK13	Q9HB14	408 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SFXN4-208	ENST00000490417	STMN3	Q9NZ72	180 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms