RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483315.1

C21orf59-208, Transcript of UPF0769 protein C21orf59, human

TSL 2

Gene C21orf59, Length 1,872 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C21orf59-208	ENST00000483315	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PCM1	Q15154	2024 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	FMO3	P31513	532 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	RUNX3	Q13761	415 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PDE7A	Q13946	482 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	VEZF1	Q14119	521 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	CYP2A13	Q16696	494 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PDZD3	Q86UT5	571 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	NAGS	Q8N159	534 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	METTL4	Q8N3J2	472 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	ASF1A	Q9Y294	204 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PI15	O43692	258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	DIRAS1	O95057	198 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	FURIN	P09958	794 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	CYP4B1	P13584	511 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	FPR1	P21462	350 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	GRK3	P35626	688 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PIK3CB	P42338	1070 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	MAP2K4	P45985	399 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	DAP	P51397	102 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	HBA1	P69905	142 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	MVK	Q03426	396 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	RPA4	Q13156	261 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	LCTL	Q6UWM7	567 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	ADCK1	Q86TW2	530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	MAL2	Q969L2	176 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	AXIN1	O15169	862 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	RGS10	O43665	173 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	MAN1A2	O60476	641 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	KAT7	O95251	611 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PCCB	P05166	539 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	FABP3	P05413	133 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	ERG	P11308	486 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	KEL	P23276	732 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	ACVR2A	P27037	513 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	SLC35A2	P78381	396 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	CDK3	Q00526	305 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	COX20	Q5RI15	118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	AGBL4	Q5VU57	503 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C21orf59-208	ENST00000483315	HORMAD1	Q86X24	394 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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