RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FAM227AF5H4B4 570 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 H0YIV9 168 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SLC28A2O43868 658 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 B4GALT2O60909 372 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TGFB1P01137 390 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 GSTA1P08263 222 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RPS17P08708 135 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RNH1P13489 461 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G2AP14555 144 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SERPINB1P30740 379 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 COLEC12Q5KU26 742 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TRIM40Q6P9F5 258 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 EMBQ6PCB8 327 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD37Q7Z713 158 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RNF175Q8N4F7 328 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TEX19Q8NA77 164 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 OR52B6Q8NGF0 335 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 HUS1BQ8NHY5 278 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 NTMT1Q9BV86 223 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PARD6BQ9BYG5 372 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 LHPPQ9H008 270 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PRDM7Q9NQW5 492 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ADGRE2Q9UHX3 823 aa19.73■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SMIM23A6NLE4 172 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB17A8MXT2 336 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 KLHL41O60662 606 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SH3BGRLO75368 114 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 NUDT17P0C025 328 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 JAK1P23458 1154 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 HPS6Q86YV9 775 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 OR2W6PQ8NHA6 318 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TSLPQ969D9 159 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1E2Q96A05 226 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 IMMP1LQ96LU5 166 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CDK15Q96Q40 435 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TUBB6Q9BUF5 446 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RIC8BQ9NVN3 520 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 DCDC2Q9UHG0 476 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 DOCK10Q96BY6 2186 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 A0A088AWK7 358 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PPP6CO00743 305 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 B3GALT2O43825 422 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 DLX3O60479 287 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CDH16O75309 829 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CLDN9O95484 217 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA7P05543 415 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 KRT15P19012 456 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TAC1P20366 129 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CERS1P27544 350 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CASRP41180 1078 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PIK3CBP42338 1070 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CCNG1P51959 295 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 MTTPP55157 894 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 BTG2P78543 158 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TGM3Q08188 693 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TRAF3Q13114 568 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ABRAXAS2Q15018 415 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 NSDHLQ15738 373 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TMEM35AQ53FP2 167 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 DEPDC1Q5TB30 811 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ZNF793Q6ZN11 406 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ATG14Q6ZNE5 492 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 QSOX2Q6ZRP7 698 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CHSY3Q70JA7 882 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 KBTBD2Q8IY47 623 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 WDR20Q8TBZ3 569 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PSMF1Q92530 271 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CAVIN3Q969G5 261 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CMTM7Q96FZ5 175 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SERINC2Q96SA4 455 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TBCDQ9BTW9 1192 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 OR51B5Q9H339 312 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 EMCNQ9ULC0 261 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RTCAO00442 366 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 DPM1O60762 260 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ALPPP05187 535 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CELA2AP08217 269 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PRR35P0CG20 571 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CDH13P55290 713 aa19.7■□□□□ 0.74
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