RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDH10Q9Y6N8 788 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNAPC5O75971 98 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GADD45AP24522 165 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD40LGP29965 261 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRB7Q14451 532 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XKR8Q9H6D3 395 aa16.58■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHEBQ15382 184 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDKL4Q5MAI5 379 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SH2B3Q9UQQ2 575 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCEAL1Q15170 157 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.57■□□□□ 0.24
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJB5O75953 348 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DGAT2Q96PD7 388 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CREBZFQ9NS37 354 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF726A6NNF4 738 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FLRT2O43155 660 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZMYND11Q15326 602 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATC1Q76KD6 591 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF186Q9NXI6 227 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OAZ2O95190 189 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC10A3P09131 477 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTNP21246 168 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HTR1EP28566 365 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VIPR1P32241 457 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD300LFQ8TDQ1 290 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNH6Q9H252 994 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR26Q9H7D7 661 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.57■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLD2O14939 933 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VILLO15195 856 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C7P10643 843 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEACAM7Q14002 265 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VMACQ2NL98 169 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATG9BQ674R7 924 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC66Q68CR7 880 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 REEP3Q6NUK4 255 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS2R9Q9NYW1 312 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSKIPQ9P0R6 139 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C5P01031 1676 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A8MUA0 341 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT-ND2P03891 347 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GINS1Q14691 196 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPEARQ8WU66 669 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SGCDQ92629 289 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF121Q9H920 327 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 E7EQ34 232 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYN1P17600 705 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP2K3P46734 347 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPIN3Q5JUX0 258 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.56■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.56■□□□□ 0.24
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