RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM156Q8N614 296 aa24.6■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 PBKQ96KB5 322 aa24.6■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.6■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 NAT9Q9BTE0 207 aa24.6■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 RHBGQ9H310 441 aa24.6■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 ITGA10O75578 1167 aa24.59■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 MYO1DO94832 1006 aa24.59■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 SERPINA6P08185 405 aa24.59■■□□□ 1.53
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PBRM1-218ENST00000458294 MS4A14Q96JA4 679 aa24.59■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 KLHL31Q9H511 634 aa24.59■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 FBXW2Q9UKT8 454 aa24.59■■□□□ 1.53
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PBRM1-218ENST00000458294 HCFC1P51610 2035 aa24.58■■□□□ 1.53
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PBRM1-218ENST00000458294 NXPE4Q6UWF7 544 aa24.58■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 MDGA2Q7Z553 956 aa24.58■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 TMPRSS11BQ86T26 416 aa24.58■■□□□ 1.53
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PBRM1-218ENST00000458294 FAM45AQ8TCE6 357 aa24.58■■□□□ 1.53
PBRM1-218ENST00000458294 CERS2Q96G23 380 aa24.58■■□□□ 1.53
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PBRM1-218ENST00000458294 RNF6Q9Y252 685 aa24.58■■□□□ 1.53
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PBRM1-218ENST00000458294 SBSNQ6UWP8 590 aa24.57■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 CREB3L4Q8TEY5 395 aa24.57■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 RND1Q92730 232 aa24.57■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC77Q9BR77 488 aa24.57■■□□□ 1.52
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PBRM1-218ENST00000458294 KCNE2Q9Y6J6 123 aa24.57■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 C4orf51C9J302 202 aa24.56■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 KRT38O76015 456 aa24.56■■□□□ 1.52
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PBRM1-218ENST00000458294 FNTAP49354 379 aa24.56■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 SSR4P51571 173 aa24.56■■□□□ 1.52
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PBRM1-218ENST00000458294 SLC22A14Q9Y267 594 aa24.56■■□□□ 1.52
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PBRM1-218ENST00000458294 HSD17B7P56937 341 aa24.55■■□□□ 1.52
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PBRM1-218ENST00000458294 MSX1P28360 303 aa24.54■■□□□ 1.52
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PBRM1-218ENST00000458294 ERVK-11Q9UQG0 969 aa24.54■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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PBRM1-218ENST00000458294 A8MVJ9 347 aa24.53■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 CLDN4O14493 209 aa24.53■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 BANF1O75531 89 aa24.53■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 PDE9AO76083 593 aa24.53■■□□□ 1.52
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R7Q15435 360 aa24.53■■□□□ 1.52
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