RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456572.2

TRBV26-201, Transcript of T cell receptor beta variable 26 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV26, Length 344 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV26-201ENST00000456572 FTHL17Q9BXU8 183 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa3.6□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ERCC6L2Q5T890 1561 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 PRDM2Q13029 1718 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 A0A087WZY1 265 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 OGTO15294 1046 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 CHADO15335 359 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 GRID2O43424 1007 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 NME2P1O60361 137 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 DFFBO76075 338 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 KRT6BP04259 564 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 PROS1P07225 676 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ANPEPP15144 967 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 SCP2P22307 547 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 IFNAR2P48551 515 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 KRT6CP48668 564 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TRPC1P48995 793 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 HNMTP50135 292 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 HMGA2P52926 109 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 DSCR9P59020 149 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 LINC00205P59089 165 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 SSTP61278 116 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 FUT7Q11130 342 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 RAPSNQ13702 412 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ITGA9Q13797 1035 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 CEACAM7Q14002 265 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TRIM29Q14134 588 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 PDIA5Q14554 519 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 P2RY6Q15077 328 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TECRLQ5HYJ1 363 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TEX35Q5T0J7 233 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 G2E3Q7L622 706 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 BNIPLQ7Z465 357 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 PIGZQ86VD9 579 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 KIRREL3Q8IZU9 778 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 SLC37A3Q8NCC5 494 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 FBXO30Q8TB52 745 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 SLC35C1Q96A29 364 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 CXorf58Q96LI9 332 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TXN2Q99757 166 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 CARD6Q9BX69 1037 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 ACTR8Q9H981 624 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 CENPMQ9NSP4 180 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 EXOC1Q9NV70 894 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 RNF186Q9NXI6 227 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 FBXL4Q9UKA2 621 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 SATB2Q9UPW6 733 aa3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TRBV26-201ENST00000456572 DOCK7Q96N67 2140 aa3.59□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 SOGA1O94964 1423 aa3.59□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 GOLGA3Q08378 1498 aa3.59□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 TOP2BQ02880 1626 aa3.59□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 A0A1B0GWJ7 208 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 A8MVM7 634 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 ANGPT2O15123 496 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 CLDN3O15551 220 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 GLRA3O75311 464 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 SAP30O75446 220 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 OAZ2O95190 189 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 SYNGR4O95473 234 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 CT45A8P0DMV1 189 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 CT45A9P0DMV2 189 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 FBLP22087 321 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 FCARP24071 287 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 CYP2F1P24903 491 aa3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 STIP1P31948 543 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
TRBV26-201ENST00000456572 DCTP40126 519 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms