RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DLGAP3O95886 979 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COL9A1P20849 921 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCR7P32248 378 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TTLL9Q3SXZ7 439 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAET1GQ6H3X3 334 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 USP43Q70EL4 1123 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PROX1Q92786 737 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABCG2Q9UNQ0 655 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DOCK9Q9BZ29 2069 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR2AG2A6NM03 316 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SGTAO43765 313 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AIREO43918 545 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SEMG1P04279 462 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FOSL2P15408 326 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LIPAP38571 399 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.54■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NUMA1Q14980 2115 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HAT1O14929 419 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TAPBPO15533 448 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TSPAN6O43657 245 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AP2A2O94973 939 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCDH8O95206 1070 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPNP16150 400 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AOAHP28039 575 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PTPN6P29350 595 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPR1P46091 355 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DPTQ07507 201 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GTF2H3Q13889 308 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AMER2Q8N7J2 671 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRPS1Q9UHF7 1281 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGLON5A6NGN9 336 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SHISA7A6NL88 538 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ULK1O75385 1050 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNX4O95219 450 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNTTP04053 509 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GLULP15104 373 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HSPA7P48741 367 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HMGCS1Q01581 520 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IL1RL1Q01638 556 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LAPTM4AQ15012 233 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DESI1Q6ICB0 168 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAHD1Q6P587 224 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GANCQ8TET4 914 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 APH1BQ8WW43 257 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FBRSQ9HAH7 460 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF6Q9Y252 685 aa16.53■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 M0R082 166 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CBSLP0DN79 551 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BCKDHAP12694 445 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CD72P21854 359 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CBSP35520 551 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CTSKP43235 329 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NR4A2P43354 598 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SEPHS1P49903 392 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CTSCP53634 463 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLDN8P56748 225 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TPRG1LQ5T0D9 272 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C6orf183Q5T699 404 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MLIPQ5VWP3 458 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AHSA2Q719I0 299 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RGL4Q8IZJ4 473 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 METTL4Q8N3J2 472 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM3CQ92520 227 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 USP7Q93009 1102 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NTMT1Q9BV86 223 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NEK6Q9HC98 313 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRT84Q9NSB2 600 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OARD1Q9Y530 152 aa16.52■□□□□ 0.24
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MANBAO00462 879 aa16.51■□□□□ 0.23
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DSCR3O14972 297 aa16.51■□□□□ 0.23
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCDHGA12O60330 932 aa16.51■□□□□ 0.23
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DPM1O60762 260 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms