RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435165.2

SGIP1-206, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-206ENST00000435165 GLRA3O75311 464 aa3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 KDM4BO94953 1096 aa3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 LYPLA2O95372 231 aa3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 CDK1P06493 297 aa3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 LYNP07948 512 aa3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa3.63□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 CD36P16671 472 aa3.63□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 DCTDP32321 178 aa3.63□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 RNFT2Q96EX2 444 aa3.63□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 ASCL2Q99929 193 aa3.63□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 ZNF583Q96ND8 569 aa3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 BTBD9Q96Q07 612 aa3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 MYOCQ99972 504 aa3.63□□□□□ -1.83
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