RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 FAM169AQ9Y6X4 670 aa5.94□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 C9J4A7 227 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFAB1O14561 156 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 TTI1O43156 1089 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGEF9O43307 516 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 DDIT4Q9NX09 232 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 FETUBQ9UGM5 382 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1257Q9ULG3 409 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 CFAP69A5D8W1 941 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 IDSB3KWA1 339 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 SNX2O60749 519 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 CRLF1O75462 422 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 UBXN7O94888 489 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 ONECUT2O95948 504 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 IGSF6O95976 241 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM23P36406 574 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 HADHAP40939 763 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 CETN2P41208 172 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 GCLMP48507 274 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 TDGF1P3P51864 188 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 PTK6Q13882 451 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 ITIH4Q14624 930 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 TRADDQ15628 312 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 C3AR1Q16581 482 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 UGP2Q16851 508 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 SHEQ5VZ18 495 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 FAM92BQ6ZTR7 304 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRK-211ENST00000429595 RCOR2Q8IZ40 523 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 MCOLN2Q8IZK6 566 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 EXD1Q8NHP7 514 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 TEKT4Q8WW24 435 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 CPT1BQ92523 772 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-211ENST00000429595 HSFY1Q96LI6 401 aa5.92□□□□□ -1.46
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