RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421462.5

PKP4-204, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 3,099 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-204ENST00000421462 GON7Q9BXV9 100 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.97■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 PRAMEF4O60810 478 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 MAPK12P53778 367 aa15.97■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.97■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa15.97■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 OR8H3Q8N146 312 aa15.97■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.97■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.97■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 MYL12BO14950 172 aa15.96■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 MTX2O75431 263 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 HIST1H2ADP20671 130 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 ITGALP20701 1170 aa15.96■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 GZMKP49863 264 aa15.96■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 IRF8Q02556 426 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 P2RY14Q15391 338 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.96■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 DHRS9Q9BPW9 319 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.96■□□□□ 0.15
PKP4-204ENST00000421462 AP5M1Q9H0R1 490 aa15.96■□□□□ 0.15
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PKP4-204ENST00000421462 HBQ1P09105 142 aa15.96■□□□□ 0.14
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PKP4-204ENST00000421462 NFATC2Q13469 925 aa15.96■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 IL18Q14116 193 aa15.96■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 CCL14Q16627 93 aa15.96■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.142e-8■■■□□ 14.6
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PKP4-204ENST00000421462 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.96■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 TM9SF2Q99805 663 aa15.96■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.96■□□□□ 0.14
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PKP4-204ENST00000421462 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa15.95■□□□□ 0.14
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PKP4-204ENST00000421462 MGAT4DA6NG13 374 aa15.95■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 BTN3A3O00478 584 aa15.95■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 PRAMEF10O60809 474 aa15.95■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 NCR1O76036 304 aa15.95■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 SCG5P05408 212 aa15.95■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.95■□□□□ 0.14
PKP4-204ENST00000421462 XKR6Q5GH73 641 aa15.95■□□□□ 0.14
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