RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 RGS6P49758 472 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TAS2R50P59544 299 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TBPL1P62380 186 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 MICAQ29983 383 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 USP43Q70EL4 1123 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 CPA6Q8N4T0 437 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 AQP11Q8NBQ7 271 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 LMLNQ96KR4 655 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 IL17FQ96PD4 163 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ACAT2Q9BWD1 397 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 LINC00597Q9H2U6 94 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 IFT52Q9Y366 437 aa13.49□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 NPIPB8E9PQR5 432 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 RFXAPO00287 272 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 WWP2O00308 870 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 NPC1O15118 1278 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ADAMDEC1O15204 470 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 PRMT3O60678 531 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 POP4O95707 220 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 KLK1P06870 262 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 CTSLP07711 333 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 SOX3P41225 446 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 C2orf80Q0P641 193 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 RAB33AQ14088 237 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 GRIN2CQ14957 1233 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 HTR3DQ70Z44 454 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 VPS37AQ8NEZ2 397 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TCEAL4Q96EI5 215 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ABCG4Q9H172 646 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 MMP27Q9H306 513 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 RERGLQ9H628 205 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 BTNL2Q9UIR0 455 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 HS3ST2Q9Y278 367 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 SMIM30A4D0T7 59 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 H0YIV9 168 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 PLK4O00444 970 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 CCL16O15467 120 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 KLHL18O94889 574 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 SLCO2B1O94956 709 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 RECKO95980 971 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 GASTP01350 101 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 CNR2P34972 360 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 PTGER1P34995 402 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 OPRD1P41143 372 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 DUSP7Q16829 419 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM220Q6QAJ8 160 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 MINDY2Q8NBR6 621 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF480Q8WV37 535 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 WFDC6Q9BQY6 131 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ACER3Q9NUN7 267 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 CLEC2DQ9UHP7 191 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 PRKAB1Q9Y478 270 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa13.48□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 A8MV72 311 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 RTCAO00442 366 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 AP3D1O14617 1153 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 SLC16A5O15375 505 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 PIK3CBP42338 1070 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 DEFB103AP81534 67 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 CDK6Q00534 326 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC74AQ0VAA2 488 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 LRIT3Q3SXY7 679 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ZMAT1Q5H9K5 638 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 AKAP14Q86UN6 197 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ATL1Q8WXF7 558 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 COQ8BQ96D53 544 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 FKBP14Q9NWM8 211 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 KLHL42Q9P2K6 505 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 GULP1Q9UBP9 304 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TRBC2A0A5B9 178 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 K7ESM1 405 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 KMOO15229 486 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 ZW10O43264 779 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 LRRTM2O43300 516 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TGM5O43548 720 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 TLE2Q04725 743 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.47□□□□□ -0.25
CNGA3-204ENST00000409937 PAQR6Q6TCH4 344 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms