RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 HTR1BP28222 390 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTR1BP42025 376 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ALDH9A1P49189 494 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G16P53816 162 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C21orf58P58505 322 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTR1AP61163 376 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HBA1P69905 142 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CSNK1G2P78368 415 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MYBPC1Q00872 1141 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CTBSQ01459 385 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GAB1Q13480 694 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 VMACQ2NL98 169 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 MS4A8Q9BY19 250 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM168Q9H0V1 697 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RHBGQ9H310 441 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NTN4Q9HB63 628 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 TRPV5Q9NQA5 729 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PRB8 838 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ISM1B1AKI9 464 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 PPM1DO15297 605 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNJ13O60928 360 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CCNDBP1O95273 360 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RASAL1O95294 804 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FKBP9O95302 570 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 ATP6V1B1P15313 513 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 CRATP43155 626 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MAPK12P53778 367 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 CCINQ13939 588 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC32Q14392 662 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NFATC4Q14934 902 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS53Q2L4Q9 553 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MPEG1Q2M385 716 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO43Q4G163 708 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 Q6ZS52 159 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FKBP9P1Q75LS8 142 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PTOV1Q86YD1 416 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZZZ3Q8IYH5 903 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR2L8Q8NGY9 312 aa3.8□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 DNASE1L2Q92874 299 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MAL2Q969L2 176 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PYURFQ96I23 114 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ADI1Q9BV57 179 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MYNNQ9NPC7 610 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SIRT5Q9NXA8 310 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C5AR2Q9P296 337 aa3.8□□□□□ -1.8
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