RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396308.3

VAMP1-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene VAMP1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-202ENST00000396308 COQ5Q5HYK3 327 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 PHF19Q5T6S3 580 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 REP15Q6BDI9 236 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 KCT2Q8NC54 265 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 PPCDCQ96CD2 204 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 KLHL29Q96CT2 875 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 RCN3Q96D15 328 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 CLMPQ9H6B4 373 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 WDR41Q9HAD4 459 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 FAM60AQ9NP50 221 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 GID8Q9NWU2 228 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 RP1P56715 2156 aa14.66□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 A0A0G2JN53 185 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 A0A1W2PP18 115 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 A0A1W2PQM1 296 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 AIM2O14862 343 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 ANKRD28O15084 1053 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 P2RX6O15547 441 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 OR2B3O76000 313 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 GBAP04062 536 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 MSL3P1P0C860 447 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 CD59P13987 128 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 TACR1P25103 407 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 PTPN4P29074 926 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 KIR3DL1P43629 444 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 TAS2R50P59544 299 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 KLC1Q07866 573 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 C2orf80Q0P641 193 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 HYAL2Q12891 473 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 ILKQ13418 452 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 GPR180Q86V85 440 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 D2HGDHQ8N465 521 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 OR8K5Q8NH50 307 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM74Q96NL1 305 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 KLHL31Q9H511 634 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 REEP4Q9H6H4 257 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP1-202ENST00000396308 A0A0A6YYD5 115 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 C4orf47A7E2U8 309 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 SH3BP5O60239 455 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 SCELO95171 688 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 PGRP06401 933 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 IL3P08700 152 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 T-ENOLP0DO92 83 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 DRD2P14416 443 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CERS1P27544 350 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ALDH9A1P49189 494 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 EMP3P54852 163 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ITGA1P56199 1179 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NCALDP61601 193 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 E2F1Q01094 437 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CFHR1Q03591 330 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 SLAMF1Q13291 335 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 MUM1Q2TAK8 710 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 DEFB134Q4QY38 66 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 CPTPQ5TA50 214 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 NATD1Q8N6N6 113 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP1-202ENST00000396308 ROPN1LQ96C74 230 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms