RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391002.1

SNORD12-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 12, humanhuman

BASIC

Gene SNORD12, Length 90 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD12-201ENST00000391002 GEMP55040 296 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 C21orf58P58505 322 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 DSCR9P59020 149 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ACTR1AP61163 376 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CSNK2BP67870 215 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 TUBA1BP68363 451 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 NUCB2P80303 420 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 NAAAQ02083 359 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 SLC34A1Q06495 639 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 LTBQ06643 244 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ARL16Q0P5N6 197 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CNTN1Q12860 1018 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 IL24Q13007 206 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CHIT1Q13231 466 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 GPR17Q13304 367 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 GPR50Q13585 617 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CEACAM7Q14002 265 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 KEAP1Q14145 624 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 KIR2DS3Q14952 304 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 TRIP10Q15642 601 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CHI3L2Q15782 390 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 STXBP2Q15833 593 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CARTPTQ16568 116 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 STX1AQ16623 288 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 DUSP5Q16690 384 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 PHKG1Q16816 387 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF585BQ52M93 769 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF789Q5FWF6 425 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ARMCX4Q5H9R4 360 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 FAM76BQ5HYJ3 339 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 SLC35D3Q5M8T2 416 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 RABGAP1LQ5R372 815 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 C9orf50Q5SZB4 431 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 AWAT2Q6E213 333 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 NEK5Q6P3R8 708 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CASC1Q6TDU7 716 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 REG3GQ6UW15 175 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 UQCC3Q6UW78 93 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 Q6ZRP5 223 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CREB3L2Q70SY1 520 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 Q71RC1 249 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 SMIM29Q86T20 159 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF554Q86TJ5 538 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 PRUNE1Q86TP1 453 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ISCA2Q86U28 154 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 PIM3Q86V86 326 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CACUL1Q86Y37 369 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 LACC1Q8IV20 430 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 C4orf19Q8IY42 314 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 KIRREL3Q8IZU9 778 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 SPEM1Q8N4L4 309 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 DCLK2Q8N568 766 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 LRRC17Q8N6Y2 441 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 FAM133AQ8N9E0 248 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 SLC37A3Q8NCC5 494 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CCDC197Q8NCU1 140 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 RDM1Q8NG50 284 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 OR7A2PQ8NGA2 310 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 OR4F17Q8NGA8 305 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 OR52M1Q8NGK5 317 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 OR4F5Q8NH21 305 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 OR1L3Q8NH93 324 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 FAM110BQ8TC76 370 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 MAGEC3Q8TD91 643 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 RNF139Q8WU17 664 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 FAM216AQ8WUB2 273 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CCDC107Q8WV48 283 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 HPSE2Q8WWQ2 592 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 METTL21AQ8WXB1 218 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 ZNF606Q8WXB4 792 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 PHYHIPQ92561 330 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 GLYATL1Q969I3 302 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 TMEM143Q96AN5 459 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 TMEM45BQ96B21 275 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 SLCO4A1Q96BD0 722 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 RAB39BQ96DA2 213 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 CDCA5Q96FF9 252 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 PGM2Q96G03 612 aa0.99□□□□□ -2.25
SNORD12-201ENST00000391002 COG3Q96JB2 828 aa0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms