RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365490.1

RN7SKP249-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP249, Length 355 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP249-201ENST00000365490 MCM8Q9UJA3 840 aa9.27□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 RARRES3Q9UL19 164 aa9.27□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.27□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.27□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPEGQ15772 3267 aa9.27□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 EFCAB7A8K855 629 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 H0YIG0 161 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC22A2O15244 555 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF749O43361 778 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 FOXS1O43638 330 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMPRSS11DO60235 418 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PCDH7O60245 1069 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRMT3O60678 531 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 MYO1DO94832 1006 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 G6PDP11413 515 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCL4P13236 92 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 GPX3P22352 226 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAPK1P28482 360 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAP1GDS1P52306 607 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARSFP54793 590 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 MTTPP55157 894 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 CLDN8P56748 225 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 BTN3A2P78410 334 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 RUNX2Q13950 521 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 MUM1Q2TAK8 710 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.933e-9■■■■■ 550.9
RN7SKP249-201ENST00000365490 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 MED25Q71SY5 747 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 NUDT13Q86X67 352 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PDSS2Q86YH6 399 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 LIX1Q8N485 282 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 C1orf50Q9BV19 199 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 DLL3Q9NYJ7 618 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 ASB4Q9Y574 426 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPTBP11277 2137 aa9.26□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 KIF26BQ2KJY2 2108 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A088AWK7 358 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A0G2JN53 185 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 CAPN14A8MX76 684 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 FCHO1O14526 889 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 DSCR3O14972 297 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 DCTN3O75935 186 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 B3GALT4O96024 378 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 JAK1P23458 1154 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 SSR2P43308 183 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 ASMTP46597 345 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 CLDN6P56747 220 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAB15P59190 212 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 FOXM1Q08050 763 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLAMF1Q13291 335 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 SQLEQ14534 574 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 DEFB134Q4QY38 66 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 C6orf89Q6UWU4 347 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 MIER2Q8N344 545 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 FITM2Q8N6M3 262 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR9A4Q8NGU2 314 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.25□□□□□ -0.93
RN7SKP249-201ENST00000365490 EGLN2Q96KS0 407 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms