RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 CUEDC2Q9H467 287 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH2D4AQ9H788 454 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 C3orf14Q9HBI5 128 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 AMBNQ9NP70 447 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 EQTNQ9NQ60 294 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLKQ9UBT6 870 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBQLN2Q9UHD9 624 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF229Q9UJW7 825 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLAGL1Q9UM63 463 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SATB2Q9UPW6 733 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF24Q9Y225 148 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF835Q9Y2P0 537 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYO16Q9Y6X6 1858 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1B0GUA9 196 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 EFCAB7A8K855 629 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF724A8MTY0 619 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANHXE9PGG2 379 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIP5K1CO60331 668 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNX3O60493 162 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERF1AO75920 110 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 UFL1O94874 794 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANGPTL1O95841 491 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD4P01730 458 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3-23P01764 117 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR9G9P0C7N8 305 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNMTP11086 282 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 F3P13726 295 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CELP19835 753 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGP20916 626 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNASE1P24855 282 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPA1P27694 616 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD34P28906 385 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL9P32969 192 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 FEN1P39748 380 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CETN2P41208 172 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCR9P51686 369 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 DIO3P55073 304 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDH8P55286 799 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRAMEP78395 509 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPTX1Q15818 432 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHRFAM7AQ494W8 412 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 C6orf136Q5SQH8 315 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIPJQ5W064 366 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR27Q6MZM9 219 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEPROQ6NW34 567 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM154Q6P9G4 183 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 OLFM4Q6UX06 510 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q71RC1 249 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHST9Q7L1S5 443 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CALHM3Q86XJ0 350 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDTC1Q8N5D0 677 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TEX26Q8N6G2 289 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF781Q8N8C0 355 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 BEST4Q8NFU0 473 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARNTL2Q8WYA1 636 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLAMF9Q96A28 289 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 GUCD1Q96NT3 240 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PINK1Q9BXM7 581 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCGF6Q9BYE7 350 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC2A11Q9BYW1 496 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDCBP2Q9H190 292 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 OPA3Q9H6K4 179 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 C10orf88Q9H8K7 445 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF702PQ9H963 129 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF221Q9UK13 617 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 LTBP1Q14766 1721 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PPQ1 181 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 FSD2A1L4K1 749 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ICOSLGO75144 302 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP6AP2O75787 350 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CBR3O75828 277 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 GJB5O95377 273 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNTTP04053 509 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 YES1P07947 543 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLTBP09497 229 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 SBK2P0C263 348 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 LAMP1P11279 417 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-170P-201ENST00000362832 P4HA1P13674 534 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms