RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361530.10

CNKSR1-201, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNKSR1, Length 2,625 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-201ENST00000361530 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 LGI4Q8N135 537 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF366Q8N895 744 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 OR51B5Q9H339 312 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 SPASTQ9UBP0 616 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 PSMD11O00231 422 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 PCDH17O14917 1159 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 CCL16O15467 120 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 ATG13O75143 517 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 DLGAP3O95886 979 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 GABRB1P18505 474 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 CTSKP43235 329 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 PRLHRP49683 370 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 SCARB2Q14108 478 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 MICAQ29983 383 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 IFI44LQ53G44 452 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 MLIPQ5VWP3 458 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 TIFAQ96CG3 184 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.9□□□□□ -0.02
CNKSR1-201ENST00000361530 METTL15A6NJ78 407 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 TBPL1P62380 186 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 TLE2Q04725 743 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 E2F2Q14209 437 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 GRIN2CQ14957 1233 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF284Q2VY69 593 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF404Q494X3 552 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 COLEC12Q5KU26 742 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 FCGR1BQ92637 280 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 IRF7Q92985 503 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 MYDGFQ969H8 173 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 PLXNA2O75051 1894 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 DSCR3O14972 297 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 PRAMEF10O60809 474 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 PTHP01270 115 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ADRA2AP08913 450 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 FURINP09958 794 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 WEE1P30291 646 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 CYP4F2P78329 520 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 RNF130Q86XS8 419 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 MMP21Q8N119 569 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 POC5Q8NA72 575 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF675Q8TD23 568 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 AP2M1Q96CW1 435 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 DEFB118Q96PH6 123 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 OR51E2Q9H255 320 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 TBX1O43435 398 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 TLL1O43897 1013 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 C1orf105O95561 183 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ANXA8P13928 327 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 LAG3P18627 525 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 UGT2B10P36537 528 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 PRIM2P49643 509 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 C2orf80Q0P641 193 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 LILRA6Q6PI73 481 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 AKAP14Q86UN6 197 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ACER3Q9NUN7 267 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 ADORA3P0DMS8 318 aa14.88□□□□□ -0.03
CNKSR1-201ENST00000361530 S100A1P23297 94 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms