RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 OR6T1Q8NGN1 323 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SUN3Q8TAQ9 357 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MED8Q96G25 268 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ARMCX1Q9P291 453 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A7Q9Y694 548 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CAPN8A6NHC0 703 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RNF212BA8MTL3 300 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TAAR5O14804 337 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TBX10O75333 385 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PEX2P28328 305 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 BMP8BP34820 402 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RPL38P63173 70 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RAB40BQ12829 278 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRF1Q5T601 910 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FSTL4Q6MZW2 842 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SKA3Q8IX90 412 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 UXS1Q8NBZ7 420 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RNF31Q96EP0 1072 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SEC22CQ9BRL7 303 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ASPNQ9BXN1 380 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CDT1Q9H211 546 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ASB8Q9H765 288 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0A6YYH2 397 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PQY0 241 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 A6NJ64 397 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 D6RAR5 112 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 H0YGN5 161 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TLR4O00206 839 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CDC7O00311 574 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 B4GALT5O43286 388 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CSF2RAP15509 400 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HOXA9P31269 272 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RPA4Q13156 261 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GBX1Q14549 363 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP19Q14CB8 494 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MAPK14Q16539 360 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 BCL2A1Q16548 175 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MBLAC2Q68D91 279 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 NOXA1Q86UR1 476 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR7G3Q8NG95 312 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RAD51AP1Q96B01 352 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC35G5Q96KT7 338 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 DOHHQ9BU89 302 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 NUDT9Q9BW91 350 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CHST7Q9NS84 486 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OARD1Q9Y530 152 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 NFS1Q9Y697 457 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 A0A075B6Q4 140 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D3BA6NDS4 549 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 H7C1Q1 480 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 NUDT14O95848 222 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MATN1P21941 496 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FSHRP23945 695 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MAGEA11P43364 429 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GXYLT1Q4G148 440 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ASB17Q8WXJ9 295 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC9A6Q92581 669 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PHF21BQ96EK2 531 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 P2RY11Q96G91 374 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 EBF3Q9H4W6 596 aa4.75□□□□□ -1.65
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