RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 FZD9O00144 591 aa16.02■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF250P15622 560 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 ZNF33BQ06732 778 aa16.02■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 CCL15Q16663 113 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.02■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 MROH8Q9H579 483 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-201ENST00000320580 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.02■□□□□ 0.16
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PACS1-201ENST00000320580 JUNDP17535 347 aa16.02■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.02■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.02■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.02■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.02■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 A6NIN4 97 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 LRRC32Q14392 662 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PRSS36Q5K4E3 855 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 MFSD14CQ5VZR4 134 aa16.01■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 FAM25EA8MYX2 175 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.01■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 TRIM64A6NGJ6 449 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TRIM64BA6NI03 449 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SSX5O60225 188 aa16.01■□□□□ 0.15
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PACS1-201ENST00000320580 SMSP52788 366 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 GLCCI1Q86VQ1 547 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TBX5Q99593 518 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 GSX2Q9BZM3 304 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SEC14L3Q9UDX4 400 aa16.01■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SCN7AQ01118 1682 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 AOC2O75106 756 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ASAH1Q13510 395 aa16■□□□□ 0.15
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