RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299339.2

CLDN10-201, Transcript of claudin 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN10, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10-201ENST00000299339 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 FBXO27Q8NI29 283 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 AGAP11Q8TF27 550 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 STMN2Q93045 179 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 RAB7BQ96AH8 199 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ROPN1LQ96C74 230 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 VPS35Q96QK1 796 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 OR52B2Q96RD2 323 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 COPS8Q99627 209 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 THTPAQ9BU02 230 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 NTMT1Q9BV86 223 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 HDAC8Q9BY41 377 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 DYRK4Q9NR20 520 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 CROTQ9UKG9 612 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 KLHL33A6NCF5 533 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 A6NCN8 305 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 E9PBE3 544 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 UBXN8O00124 270 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 BTN3A1O00481 513 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 CCL22O00626 93 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 E2F3O00716 465 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 B4GAT1O43505 415 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 KLHL41O60662 606 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 PEX11AO75192 247 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 NIPSNAP2O75323 286 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 KATNA1O75449 491 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 SUPT3HO75486 399 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 FTH1P02794 183 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 PRR35P0CG20 571 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 IDO1P14902 403 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 CTPS1P17812 591 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 GNAZP19086 355 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 EPHA3P29320 983 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 BLKP51451 505 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 HK3P52790 923 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 MTTPP55157 894 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 AP1S2P56377 157 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 OR1D5P58170 312 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 KRTAP10-9P60411 292 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 STX1BP61266 288 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 YPEL5P62699 121 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 AP2B1P63010 937 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 SLC34A1Q06495 639 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ELP6Q0PNE2 266 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 SGCGQ13326 291 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 CHRNA6Q15825 494 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 LRRC66Q68CR7 880 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 NXNQ6DKJ4 435 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ERAP2Q6P179 960 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 DPPA4Q7L190 304 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 FAM129CQ86XR2 697 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 DSELQ8IZU8 1212 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 ZBTB2Q8N680 514 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.28□□□□□ -1.4
CLDN10-201ENST00000299339 DLG3Q92796 817 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms